Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms