Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms