Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOP08100 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOP08100 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOP08100 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOP08100 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOP08100 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOP08100 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOP08100 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOP08100 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOP08100 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOP08100 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOP08100 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOP08100 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOP08100 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOP08100 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOP08100 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOP08100 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOP08100 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHOP08100 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHOP08100 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHOP08100 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHOP08100 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHOP08100 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHOP08100 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHOP08100 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHOP08100 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHOP08100 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHOP08100 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHOP08100 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHOP08100 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHOP08100 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHOP08100 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHOP08100 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHOP08100 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHOP08100 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHOP08100 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHOP08100 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHOP08100 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHOP08100 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHOP08100 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHOP08100 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHOP08100 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHOP08100 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RHOP08100 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHOP08100 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHOP08100 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RHOP08100 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHOP08100 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHOP08100 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHOP08100 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHOP08100 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHOP08100 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHOP08100 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHOP08100 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHOP08100 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHOP08100 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHOP08100 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHOP08100 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHOP08100 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHOP08100 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHOP08100 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHOP08100 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHOP08100 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHOP08100 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHOP08100 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHOP08100 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHOP08100 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHOP08100 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHOP08100 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHOP08100 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHOP08100 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHOP08100 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHOP08100 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHOP08100 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RHOP08100 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHOP08100 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHOP08100 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHOP08100 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHOP08100 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHOP08100 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHOP08100 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHOP08100 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHOP08100 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHOP08100 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RHOP08100 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RHOP08100 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHOP08100 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RHOP08100 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHOP08100 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHOP08100 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHOP08100 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RHOP08100 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHOP08100 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHOP08100 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHOP08100 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHOP08100 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHOP08100 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHOP08100 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHOP08100 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHOP08100 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms