Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms