Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms