Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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SCN2BO60939 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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SCN2BO60939 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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SCN2BO60939 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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SCN2BO60939 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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