Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGTAO43765 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGTAO43765 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGTAO43765 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGTAO43765 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGTAO43765 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGTAO43765 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGTAO43765 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGTAO43765 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGTAO43765 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGTAO43765 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGTAO43765 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGTAO43765 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGTAO43765 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGTAO43765 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGTAO43765 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SGTAO43765 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGTAO43765 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGTAO43765 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGTAO43765 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SGTAO43765 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGTAO43765 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGTAO43765 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGTAO43765 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGTAO43765 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGTAO43765 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGTAO43765 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGTAO43765 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGTAO43765 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SGTAO43765 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGTAO43765 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGTAO43765 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGTAO43765 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGTAO43765 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGTAO43765 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGTAO43765 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGTAO43765 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGTAO43765 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGTAO43765 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGTAO43765 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGTAO43765 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGTAO43765 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGTAO43765 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGTAO43765 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGTAO43765 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGTAO43765 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGTAO43765 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGTAO43765 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGTAO43765 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGTAO43765 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGTAO43765 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGTAO43765 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGTAO43765 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGTAO43765 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGTAO43765 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGTAO43765 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SGTAO43765 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SGTAO43765 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SGTAO43765 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SGTAO43765 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SGTAO43765 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SGTAO43765 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SGTAO43765 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGTAO43765 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGTAO43765 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGTAO43765 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGTAO43765 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGTAO43765 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGTAO43765 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGTAO43765 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGTAO43765 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGTAO43765 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGTAO43765 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGTAO43765 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SGTAO43765 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGTAO43765 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SGTAO43765 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SGTAO43765 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGTAO43765 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGTAO43765 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGTAO43765 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGTAO43765 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGTAO43765 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGTAO43765 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SGTAO43765 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGTAO43765 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGTAO43765 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGTAO43765 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SGTAO43765 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGTAO43765 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGTAO43765 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGTAO43765 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGTAO43765 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGTAO43765 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGTAO43765 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGTAO43765 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGTAO43765 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGTAO43765 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGTAO43765 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGTAO43765 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms