Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms