Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
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