Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms