Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP20Q9Y2K6 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms