Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW6

SATB2, DNA-binding protein SATB2, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB2Q9UPW6 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SATB2Q9UPW6 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms