Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms