Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms