Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms