Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms