Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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RNF7Q9UBF6 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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RNF7Q9UBF6 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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RNF7Q9UBF6 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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RNF7Q9UBF6 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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