Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms