Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXB0

MKS1, Meckel syndrome type 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1Q9NXB0 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MKS1Q9NXB0 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MKS1Q9NXB0 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MKS1Q9NXB0 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MKS1Q9NXB0 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MKS1Q9NXB0 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MKS1Q9NXB0 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MKS1Q9NXB0 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms