Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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UBQLN4Q9NRR5 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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