Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms