Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZL8

BPESC1, Putative BPES syndrome breakpoint region protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPESC1Q9GZL8 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BPESC1Q9GZL8 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BPESC1Q9GZL8 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BPESC1Q9GZL8 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BPESC1Q9GZL8 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BPESC1Q9GZL8 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BPESC1Q9GZL8 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BPESC1Q9GZL8 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BPESC1Q9GZL8 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BPESC1Q9GZL8 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BPESC1Q9GZL8 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BPESC1Q9GZL8 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BPESC1Q9GZL8 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BPESC1Q9GZL8 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
BPESC1Q9GZL8 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BPESC1Q9GZL8 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BPESC1Q9GZL8 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BPESC1Q9GZL8 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BPESC1Q9GZL8 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BPESC1Q9GZL8 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BPESC1Q9GZL8 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BPESC1Q9GZL8 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BPESC1Q9GZL8 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BPESC1Q9GZL8 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BPESC1Q9GZL8 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BPESC1Q9GZL8 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BPESC1Q9GZL8 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BPESC1Q9GZL8 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BPESC1Q9GZL8 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BPESC1Q9GZL8 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BPESC1Q9GZL8 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BPESC1Q9GZL8 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BPESC1Q9GZL8 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BPESC1Q9GZL8 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BPESC1Q9GZL8 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BPESC1Q9GZL8 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BPESC1Q9GZL8 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BPESC1Q9GZL8 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BPESC1Q9GZL8 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BPESC1Q9GZL8 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BPESC1Q9GZL8 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BPESC1Q9GZL8 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BPESC1Q9GZL8 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BPESC1Q9GZL8 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BPESC1Q9GZL8 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BPESC1Q9GZL8 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BPESC1Q9GZL8 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BPESC1Q9GZL8 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BPESC1Q9GZL8 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BPESC1Q9GZL8 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BPESC1Q9GZL8 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BPESC1Q9GZL8 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BPESC1Q9GZL8 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BPESC1Q9GZL8 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BPESC1Q9GZL8 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
BPESC1Q9GZL8 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BPESC1Q9GZL8 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BPESC1Q9GZL8 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BPESC1Q9GZL8 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BPESC1Q9GZL8 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
BPESC1Q9GZL8 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BPESC1Q9GZL8 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BPESC1Q9GZL8 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BPESC1Q9GZL8 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BPESC1Q9GZL8 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BPESC1Q9GZL8 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BPESC1Q9GZL8 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BPESC1Q9GZL8 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BPESC1Q9GZL8 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BPESC1Q9GZL8 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BPESC1Q9GZL8 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BPESC1Q9GZL8 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BPESC1Q9GZL8 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BPESC1Q9GZL8 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BPESC1Q9GZL8 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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