Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms