Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL356863.1-201ENST00000623378 1080 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL590542.1-201ENST00000449314 1596 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00958-201ENST00000504230 1558 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC104794.2-201ENST00000567540 1572 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 BCCIP-201ENST00000278100 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 MITD1-201ENST00000289359 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBE2D3-204ENST00000349311 838 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 CNTRL-202ENST00000373844 713 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL713923.1-201ENST00000414071 378 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008443.1-204ENST00000417281 629 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC104455.1-201ENST00000417340 736 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 THRB-AS1-201ENST00000432368 1216 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02039-201ENST00000507428 566 ntTSL 4 BASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 KNTC1-206ENST00000534995 1065 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL391152.1-201ENST00000554160 1111 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL121594.4-201ENST00000556211 1196 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 RD3L-201ENST00000557640 1201 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms