Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD9

ACTRT3, Actin-related protein T3, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT3Q9BYD9 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms