Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms