Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms