Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAF2Q96CS3 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms