Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms