Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
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PTPRUQ92729 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
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PTPRUQ92729 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
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PTPRUQ92729 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
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PTPRUQ92729 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
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PTPRUQ92729 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
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PTPRUQ92729 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
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PTPRUQ92729 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
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PTPRUQ92729 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
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PTPRUQ92729 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
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