Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms