Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms