Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms