Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms