Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms