Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.9 ms