Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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CDKN3Q16667 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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