Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FSCN1Q16658 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FSCN1Q16658 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FSCN1Q16658 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FSCN1Q16658 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
FSCN1Q16658 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FSCN1Q16658 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FSCN1Q16658 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FSCN1Q16658 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FSCN1Q16658 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FSCN1Q16658 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FSCN1Q16658 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
FSCN1Q16658 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FSCN1Q16658 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FSCN1Q16658 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FSCN1Q16658 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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