Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
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E2F4Q16254 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
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E2F4Q16254 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
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E2F4Q16254 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms