Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms