Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms