Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms