Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSPNQ14714 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSPNQ14714 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSPNQ14714 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SSPNQ14714 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSPNQ14714 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SSPNQ14714 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSPNQ14714 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SSPNQ14714 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SSPNQ14714 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSPNQ14714 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSPNQ14714 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SSPNQ14714 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SSPNQ14714 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SSPNQ14714 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SSPNQ14714 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SSPNQ14714 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SSPNQ14714 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SSPNQ14714 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SSPNQ14714 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SSPNQ14714 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SSPNQ14714 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SSPNQ14714 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SSPNQ14714 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SSPNQ14714 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SSPNQ14714 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SSPNQ14714 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SSPNQ14714 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SSPNQ14714 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SSPNQ14714 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SSPNQ14714 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SSPNQ14714 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SSPNQ14714 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SSPNQ14714 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SSPNQ14714 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SSPNQ14714 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SSPNQ14714 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
SSPNQ14714 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SSPNQ14714 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SSPNQ14714 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SSPNQ14714 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SSPNQ14714 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SSPNQ14714 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SSPNQ14714 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SSPNQ14714 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms