Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms