Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTTNQ14247 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms