Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOFQ13790 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOFQ13790 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOFQ13790 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOFQ13790 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOFQ13790 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOFQ13790 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOFQ13790 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOFQ13790 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOFQ13790 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOFQ13790 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOFQ13790 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOFQ13790 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
APOFQ13790 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOFQ13790 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOFQ13790 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOFQ13790 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOFQ13790 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOFQ13790 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOFQ13790 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOFQ13790 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOFQ13790 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOFQ13790 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOFQ13790 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
APOFQ13790 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOFQ13790 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOFQ13790 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOFQ13790 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOFQ13790 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOFQ13790 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOFQ13790 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOFQ13790 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOFQ13790 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOFQ13790 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
APOFQ13790 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOFQ13790 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOFQ13790 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOFQ13790 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOFQ13790 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOFQ13790 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOFQ13790 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOFQ13790 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOFQ13790 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOFQ13790 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOFQ13790 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
APOFQ13790 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
APOFQ13790 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOFQ13790 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOFQ13790 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOFQ13790 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
APOFQ13790 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOFQ13790 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOFQ13790 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOFQ13790 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOFQ13790 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOFQ13790 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOFQ13790 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOFQ13790 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
APOFQ13790 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
APOFQ13790 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOFQ13790 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOFQ13790 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOFQ13790 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOFQ13790 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOFQ13790 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOFQ13790 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
APOFQ13790 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOFQ13790 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOFQ13790 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOFQ13790 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOFQ13790 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOFQ13790 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOFQ13790 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOFQ13790 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
APOFQ13790 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOFQ13790 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOFQ13790 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOFQ13790 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOFQ13790 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOFQ13790 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOFQ13790 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOFQ13790 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOFQ13790 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOFQ13790 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOFQ13790 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOFQ13790 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOFQ13790 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOFQ13790 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOFQ13790 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOFQ13790 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOFQ13790 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOFQ13790 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOFQ13790 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOFQ13790 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOFQ13790 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
APOFQ13790 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOFQ13790 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOFQ13790 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOFQ13790 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOFQ13790 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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