Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
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NCOA4Q13772 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
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