Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms