Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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FOXF1Q12946 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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FOXF1Q12946 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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FOXF1Q12946 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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FOXF1Q12946 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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FOXF1Q12946 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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FOXF1Q12946 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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FOXF1Q12946 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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FOXF1Q12946 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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