Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.8 ms